La Cour des Comptes est organisée en plusieurs chambres spécialisées, chacune étant compétente dans des domaines spécifiques tels que les finances de l'État, les établissements publics ou la discipline budgétaire. Cette structuration interne lui permet d'assurer un contrôle efficace et exhaustif des finances publiques djiboutiennes.

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La Cour des comptes comprend : 

• La Chambre des Finances de l’État ; 

• La Chambre des Établissements Publics et des organismes de droit privé bénéficiaires du concours financier de l’État ou du public ; 

• La Chambre de discipline budgétaire.

 

La Cour des comptes est composée :

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Des magistrats de siège qui sont : 

• Le (a) Premier Président(e) de la Cour, 

• Les présidents des chambres, 

• Les conseillers

 

Des magistrats du parquet général qui sont : 

• Le Procureur Général ; 

• Les substituts généraux ;

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Du greffe qui comprend :

• Le Greffier en Chef ; 

• Les greffiers des chambres ;

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